С 1879 г. - ассистент в академической клинике ВМА профессора С. П. Коломина . С 1885 г. - ассистент, затем прозектор кафедры нормальной анатомии ВМА. С 1891 г. - приват-доцент, с 1897 г. профессор и первый заведующий кафедрой анатомии Санкт-Петербургского женского медицинского института, создатель музея при кафедре.

Награжден орденами Св. Станислава 1 степени (1916), Св. Владимира 3 степени, Св. Анны 2 степени.

К морфологии коронки зубов человека и животных : Анат.-антропол. исслед. / [Соч.] Прозектора Н. Батуева. - Санкт-Петербург : Воен. тип., 1894 г. Неправильность левой почечной вены и в связи с нею сохранившаяся часть левой кардинальной вены / [Соч.] Проз. Н.А. Батуева. - [Санкт-Петербург] : тип. Я. Трей, ценз. 1897 г. 12 с. Лекции по анатомии / [Соч.] Н.А. Батуева, проф. Имп. Новорос. ун-та. Одесса : 1 курс Мед. фак. Имп. Новорос. ун-та, 1900 г. Случай парного врожденного неполного наружного свища шеи у взрослого мужчины в связи с вопросом о т. наз. жаберных щелях / [Соч.] Проф. Н.А. Батуева. - Санкт-Петербург : тип. Я. Трей, 1902 г. 19 с. Лекции по анатомии костей, суставов, мышц, больших полостей, кровеносных сосудов и нервов тела человека : Применит. к изуч. препарованием на труппе / [Соч.] Проф. Новорос. ун-та Н.А. Батуева. - Одесса : типо-лит. Штаба Одесск. воен. округа, 1903 г. 277 с. Лекции по анатомии костей, суставов, мышц, больших полостей, кровеносных сосудов, с сердцем, нервов, органов дыхания, пищеварения, мочеполовых и центральной нервной системы человека : Применит. к изуч. препарованием на трупе / [Соч.] Проф. Новорос. ун-та Н.А. Батуева. - Одесса : Типо-лит. Штаба Одес. воен окр., 1907 г. 360 с Батуев Николай Александрович Руководство по нормальной анатомии : Сост. применительно к изучению препарованием на трупе / [Соч.] проф. Н. А. Батуева Под ред. проф. Н. Г. Стадницкого. [Саратов] : Гос. изд-во. Саратовское отд., 1920 г. 396 с.; 28 см. (Серия изд./ Подотд. соц. обеспечения учащихся высших учеб. заведений гор. Саратова).

Батуев, Николай Александрович // Новый энциклопедический словарь / Арсеньев К. К. СПб.: Брокгауз Ефрон (издательство), 1911 г. Т. 5. С. 105. 960 с. Батуев, Николай Александрович // Большая медицинская энциклопедия / Семашко Н. А. 1-е изд. М.: Советская энциклопедия, 1928 г. Т. 3. С. 74. 784 с. Батуев, Николай Александрович // Большая медицинская энциклопедия / Б. В. Петровский. 3-е изд. М.: Советская энциклопедия, 1988 г. Т. 29: Дополнительный. С. 74. 784 с. Волков С. В. Высшее чиновничество Российской империи. Краткий словарь. М.: Издательство: Русский фонд содействия образованию и науке, 2016 г. С. 105. Список лиц, служащих по ведомству Министерства народного просвещения на 1917 год. Петроград: Сенатская типография, 1917 г. С. 566.