В течение 5-ти лет после окончания университета Л. являлся преподавателем в Николаевской Царскосельской гимназии. С 1905 по 1911 г. Л. состоял экстраординарным, а с 1911 по 1918 - ординарным профессором русской истории в Юрьевском университете. В 1916 г. Л. назначают членом комиссии Министерства просвещения. Являлся преподавателем на высших женских курсах в Юрьеве, а также возглавлял историческое отделение юрьевских педагогических курсов. С 1919 г. профессор Воронежского государственного университета. На протяжении всего времени существования Русского юридического факультета в Праге (с 1921 по 1933 г.) Л. являлся его приват-доцентом. С октября 1923 г. Л. - профессор Русского народного (позднее - свободного) университета в Праге. С 1933 по 1940 г. работал в университете Витаутаса Великого в Каунасе в должности профессора. В августе 1941 г. Л. был принят на должность приват-доцента Вильнюсского университета, однако уже через несколько месяцев был уволен с формулировкой "превысивший установленный Статутом возраст". Чтобы хоть как-то наладить финансовое положение Л. с марта 1942 г. некоторое время работает младшим ассистентом в Институте права и хозяйства. Общественная деятельность: Весной 1919 г. стал уполномоченным Главархива по Воронежской губернии, призванным возглавить строительство местного архивного хозяйства. После революции принял активное участие в дискуссиях по «вильнюсскому вопросу» (отрицание Польшей Литовской государственности после Люблинской унии), для чего направил письмо президенту Литвы с доказательствами необоснованности официальной позиции Польши. Впоследствии для комиссии, работавшей при сейме, им был подготовлен специальный меморандум, касающийся вопроса "исторического литовского права на самостоятельную государственность". Министерство иностранных дел Литвы активно использовало данный документ во время международных переговоров. Имел орден Гедимина III степени "за заслуги перед Литвой" (1938 г.).

Тверской уезд в XVI веке: Его население и виды земельного владения. М., 1894. http://ia600306.us.archive.org/9/items/Lappo/Lappo_I_I_Tverskoy_uezd.pdf Великое княжество Литовское за время от заключения Люблинской унии до смерти Стефана Батория (1569-1586): Опыт исследования политического и общественного строя. СПб., 1901. http://ia700306.us.archive.org/9/items/Lappo/Velikoe_kniazevstvo_Litovskoe_1569-1586.pdf Полоцкая ревизия 1552 г. М., 1905. http://ia700306.us.archive.org/9/items/Lappo/Polotskaia_revizija_1552.pdf Современное состояние науки русской истории и задачи ее университетского преподавания. Юрьев, 1906. Великое княжество Литовское во второй половине XVI столетия: Литовско-Русский повет и его сеймик. Юрьев, 1911. К истории панского класса в великом княжестве Литовском. М., 1915. Западная Россия и ее соединение с Польшей в их историческом прошлом. Исторические очерки. Прага, 1924. Идея единства русского народа в Юго-Западной Руси в эпоху присоединения Малороссии к Московскому государству. Прага, 1929. http://zapadrus.su/rusmir/istf/467-2011-10-05-11-47-37.html Литовский Статут 1588 года. Каунас, 1934-1938.

Славяноведение в дореволюционной России. Биобиблиографический словарь. М.: Наука, 1979. Лит.: Пашуто В.Т. Русские историки-эмигранты в Европе. М., Наука, 1992; Аксенова Е. П., Досталь М. Ю. Русская ученая академия в Праге в годы второй мировой войны // Славяноведение. 2001. № 4. С. 31-32; Брачев В.С., Дворниченко А.Ю. Кафедра русской истории Санкт-Петербургского университета (1834—2004) / СПб. гос. ун-т. Ист. фак.- СПб.: Изд-во СПбГУ, 2004; Мякишев В.П. И.И. Лаппо – ученый с живым чувством исторической действительности // Вестник ВГУ. Серия Гуманитарные науки. 2004. № 1. URL: http://kfinkelshteyn.narod.ru/Tzarskoye_Selo/Uch_zav/Nik_Gimn/NG_prep_Lappo_Miakishev.htm (дата обращения 23.10.2012); Письма профессора И. И. Лаппо И. Я. Спрогису из Юрьева (1906-1912). Публикация и комментарий Л.В. Дубьевой // Балтийский архив. Vilnius: Издательство Вильнюсского университета, 2005. С. 392 – 408. Дубьева Л.В. «Отдаюсь науке совсем…». И. И. Лаппо - профессор русской истории Тартуского (Юрьевского) университета в 1905-1918 гг. // Балтийский архив. Русская культура в Прибалтике. IX. Vilnius, 2005. С. 374-391; Дубьева Л. Историческая наука в Тартуском университете в конце XIX – начале XX вв. (Dissertationes historiae Universitatis Tartuensis). Тарту, 2006. URL: http://dspace.utlib.ee/dspace/bitstream/handle/10062/967/dubjeval.pdf?sequence=5 (дата обращения 23.10.2012); Сидорчук И.В., Дворниченко А.Ю. И.И.Лаппо // Биографика СПбГУ. URL: https://bioslovhist.spbu.ru/person/7-lappo-ivan-ivanovich.html

Формулярный список Лаппо И.И. – РГИА ф.1349 оп.1. Д. 237. Государственный архив Воронежской области (ГАВО), ф. 441, оп. 1. д. 9. Отдел рукописей Библиотеки Академии Наук Литвы (ОР БАНЛ. Ф. 211) Отдел рукописей Библиотеки Вильнюсского университета (далее ОР БВУ) Ф. 6-63. (мемуары, переписка). Исторический архив Эстонии (Тарту) (ИАЭ). Ф. 402 (Дерптский университет)