В 1863-1871 гг. - приват-доцент, в 1871-1887 гг. - профессор Санкт-Петербургского университета.

М. начал свой исследовательский путь с изучения западноевропейской литературы, в своей магистерской диссертации он попытался в концентрированном виде проанализировать достаточно большой период истории европейской литературы, основываясь при этом не на данных источников, а на материале различных пособий. Подобный исследовательский подход получил неоднозначные оценки среди современных исследователей. Уже в 1860-1870-х гг. М. обращает свое внимание на изучение истории русской словесности, в исследовании которой он добился значительно больших результатов. В своей докторской диссертации М. продолжил традицию рассмотрения истории русских былин через их символизм, их мифологическое, сакральное значение; в центре внимания его диссертации - былины об Илье Муромце. В особенностях изображения образа данного героя М. видит отражение глубокого понимания русским народом принципов христианской веры. Однако, несмотря на большой источниковый материал, использованный в работе, еще современники отмечали недостаточный критический анализ материала. В целом на научную деятельность М. большое влияние оказали его патриотические, славянофильские взгляды, вызывавшие критику со стороны левой интеллигенции, в частности Н.А. Добролюбова. М. считал, что Россия должна опираться на единство царя, народы и веры, которое существовало в полной мере в Киевской и Московской Руси, однако в процессе монголо-татарского ига, петровских реформ, это единство постепенно размывалось. Основные статьи и выступления М. по этой теме изданы в сборнике «Славянство и Европа». После начала 1870х гг. М постепенно отходит от работы с историческими материалами и посвящает свою деятельность литературной критике. Наиболее важной его работой в этой сфере является книга «Русские писатели после Гоголя», 1874, в которой он пытается критически анализировать труды Ф.М.Достоевского, Л.Н.Толстого, И.С.Тургенева, И.А.Гончарова, А.Н.Островского и др.