1866-1870 гг. - лаборант агрономической лаборатории, затем химической лаборатории, а после технической лаборатории Императорского Казанского университета; 1870-1871 гг. - экстраординарный профессор Императорского Казанского университета; 1871-1894 гг. - ординарный профессор Императорского Казанского университета; 1894-1910 гг. - заслуженный ординарный Императорского Казанского университета; 1907-1910 гг. - декан физико-математического факультета Императорского Казанского университета.

Императорский Казанский университет: • В начале 1880 г. А.М. Зайцев был оставлен при университете для подготовки к профессорскому званию. • 1880–1885 гг. – сверхштатный ассистент. • 1885–1886 гг. – штатный хранитель минералогического кабинета. • 1886–1888 гг. – приват-доцент. Императорский Томский университет: 1888–1896 гг. – экстраординарный профессор кафедры геологии и минералогии. 1896–1907 гг. – ординарный профессор кафедры геологии и минералогии. Императорский Варшавский университет: • 1909–1916 гг. – профессор кафедры минералогии и геологии с палеонтологией естественного факультета.

В 1870-1871 гг. – доцент физико-математического факультета Новороссийского университета. В 1871-1882 гг. – профессор физико-математического факультета Казанского университета. В 1882-1897 гг. – профессор физико-математического факультета Новороссийского университета.

Императорский Томский университет: • 1 июля 1888 г. – 1893 г. – ординарный профессор по кафедре химии (с 1890 г. – кафедра неорганической и органической химии совместно с медицинской). • 1888–1889 гг. – член Правления. • 1893 г. – 1 июня 1894 г. – ординарный профессор кафедры медицинской химии.

Казанский университет: январь 1893 - 1900 гг. приват-доцент кафедры политической экономии и статистики Императорского Казанского университета; 1900-1901 гг. - экстраординарный профессор Императорского Казанского университета; 1901 - сентябрь 1918 гг. - ординарный профессор кафедры энциклопедии и истории философии права Императорского Казанского университета; Томский университет: сентябрь 1918 - декабрь 1919 гг. - ординарный профессор кафедры политэкономии и статистики юридического факультета Императорского Томского университета.

В 1860-1862 гг. - ординатор терапевтической и акушерской клиник ИХУ С 1868 г. - доцент по кафедре судебной медицины медицинского факультета ИХУ В 18757-1882 гг. - экстраординарный профессор по той же кафедре С 1883 г. - экстраординарный, с 1886 г. - ординарный профессор по кафедре фармакологии медицинского факультета ИХУ С 1893 г. - заслуженный профессор В 1893 г. вышел в отставку по выслуге лет

В 1842-1848 гг. - ординарный профессор кафедры гражданских законов Царства Польского юридического факультета ИМУ

1826-1828 – профессор кафедры диэтетики, фармакологии, истории медицины и медицинской литературы Медицинского факультета 1828-1847 – профессор кафедры терапии и клиники Медицинского факультета

С 1904 г. – приват-доцент ИВУ. С 1906 г. – приват-доцент при кафедре русского языка и словесности ИСПбУ. С 1908 г. – экстраординарный профессор по кафедре русского и церковнославянского языка и истории русской литературы ИВУ. С 1909 г. – ординарный профессор по кафедре русского и церковнославянского языка и истории русской литературы ИВУ.

1884-1890 - профессор Кафедры русской истории Историко-филологического факультета Санкт-Петербургского университета