22 декабря 1887 - 29 января 1892 гг. - приват-доцент Императорского Новороссийского (Одесского) университета; 29 января 1892 - 1 января 1896 гг. - экстраординарный профессор по кафедре механики Императорского Новороссийского (Одесского) университета; 1 января 1896 - 1909 гг. - ординарный профессор по кафедре механики Императорского Новороссийского (Одесского) университета. 14 февраля 1897 - 9 октября 1900 гг. - секретарь совета физико-математического факультета Императорского Новороссийского (Одесского) университета; 29 декабря 1904 - 9 сентября 1905 гг. - декан физико-математического факультета Императорского Новороссийского (Одесского) университета; 9 сентября 1905 - 27 июля 1907 гг. - ректор Императорского Новороссийского (Одесского) университета. апрель-май 1917 г. - преподаватель Новороссийского (Одесского) университета; с мая 1917 - 1920 гг. - профессор кафедры теоретической и практической механики и декан физико-математического факультета Новороссийского (Одесского) университета; ноябрь 1917 - февраль 1918 гг. - ректор Новороссийского (Одесского) университета.

В 1805-1810 - адъюнкт прикладной математики и опытной физики ИКУ С 1807 - секретарь Совету ИКУ В 1810 - экстраординарный прпофессор математики и опытной физики

В 1898-1901 гг. работал в Московском, в 1901-1919 в Киевском университете.

С 1891 по 1894 г.г. В. И. Зарубин состоял ординатором сифилидологической клиники Военно-медицинской академии. С 1898 по 1903 г.г. В. И. Зарубин - приват-доцент кафедры кожных и венерических болезней Императорского Харьковского университета. С 1904 г. - экстраординарный профессор по кафедре кожных и венерических болезней Императорского Новороссийского университета.

С 1862 г. - адъюнкт по кафедре хирургии медицинского факультета ИХУ С 1864 г. - экстраординарый, с 1865 г. - ординарный профессор по той же кафедре С 1882 г. - ординарный профессор по кафедре госпитальной хирургической клиники ИХУ В 1870-1889 гг. - декан медицинского факультета ИХУ С 1887 г. - заслуженный профессор

С 1824 г. начал чтение лекций по астрономии в ИХУ С 1825 г.- адъюнкт по кафедре астрономии физико-математического факультета ИХУ, в 1826-1829 гг. - секретарь факультета. В 1829-1834 гг. - ординарный профессор по той же кафедре

В 1869-1879 гг. - преподаватель, в 1879-1885 гг. - профессор факультета Восточных языков Санкт-Петербургского университета.

С 1859 г. начал чтение курса семиотики на медицинском факультете ИМУ С 1860 г. - адъюнкт по кафедре терапевтической клиники медицинского факультета ИМУ С 1862 г. - экстраординарный профессор по той же кафедре В 1864-1896 гг. - ординарный профессор по той же кафедре, директор терапевтической клиники

В 1889 г. – приват-доцент ИМУ. С 1889 г. – доцент, с 1893 г. – и.д. экстраординарного профессора по кафедре энциклопедии права ИД(Ю)У.

В 1878-1883 гг. замещал кафедру энциклопедии и истории философии права на юридическом факультете ИМУ в звании приват-доцента С 1884 г. - доцент, с того же года - экстраординарный профессор по той же кафедре С 1887 г. - и.д. ординарного профессора, в 1895-1898 гг. - ординарный профессор по той же кафедре В 1893-1898 г. - помощник ректора, с марта по июль 1898 г. - ректор ИМУ