В 1804–1832 гг. – профессор по кафедре гражданского и уголовного права ИВилУ В 1811–1817, 1827–1832 гг. – декан факультета словесных наук и изящных искусств ИВилУ

С 1852 г. - и.д. адъюнкта по кафедре начал общенародного правоведения юридического факультета ИМУ С 1855 г. - и.д. экстраординарного, с 1862 г. - и.д. ординарного профессора по той же кафедре В 1865-1870 гг. - ординарный профессор по кафедре международного права юридического факультета ИМУ С 1881 г. - заслуженный профессор

В 1885–1887 гг. – экстраординарный профессор по кафедре ИВУ. В 1887–1907 гг. – ординарный профессор по кафедре гигиены ИКУ. В 1908–1917 гг. – сверхштатный ординарный профессор по кафедре гигиены ИКУ.

Императорский Санкт-Петербургский университет: • 1889 – лаборант при физическом кабинете. Императорский Томский университет: • 1889–1903 гг. – исполняющий должность экстраординарного профессора кафедры физики. • 1903–1909 гг. – исполняющий должность ординарного профессора кафедры физики. Императорский Санкт-Петербургский университет: • В 1909 г. Ф.Я. Капустин переехал в Петербург, где состоял профессором университета.

В 1824-1825 - экстраординарный профессор кафедры политической экономии и дипломатики ИКУ В 1825-1837 - экстраординарный профессор кафедры латинского языка ИКУ Декан нравственно-политического отделения (с 1825) В 1825-1827 - и.д. секретаря Совета ИКУ

С 1840 г. – экстраординарный, с 1842 г. – ординарный профессор хирургии, в 1843–1847 гг. – декан медицинского факультета, с 1865 г. – заслуженный, с 1881 г. – сверхштатный профессор, основатель и первый руководитель факультетской хирургической клиники ИУСвВ

С 1 декабря 1907 г. – сверхштатный помощник прозектора при кафедре судебной медицины. В круг его обязанностей входила работа на станции для приготовления преципитирующих сывороток, используемых для определения группы крови. На станции также готовили эритропреципитины человека и гемолитические сыворотки для производства реакции Вассермана. Кроме этого, П.М. Караганов собрал в судебной медицинской лаборатории университета богатейшую коллекцию преципитирующих сывороток. Одним из его наставников был профессор М.Ф. Попов. С 16 мая 1914 г. П.М. Караганов – приват-доцент, с 1 января 1915 г. – прозектор при кафедре судебной медицины и токсикологии. На заседании медицинского факультета в сентябре 1919 г. ему было поручено преподавание по вакантной после смерти М.Ф. Попова кафедре судебной медицины. С 1920 г. – профессор и заведующий кафедрой судебной медицины Томского университета.

С 1873 г. - доцент по кафедре энциклопедии права юридического факультета ИМУ С 1875 г. - ординарный профессор по той же кафедре

С 1865 г. - профессор Новороссийского университета. С 1869 до 1884 г. декан физико-математического факультета. С 1876 г. после истечения 25-летнего срока преподавания профессор вне штата. С 1879 г. ординарный профессор.

С 1873 г. – профессорский стипендиат при кафедре русской истории ИМУ В 1878–1879 гг. – приват-доцент ИМУ В 1879–1884 гг. – экстраординарный профессор по кафедре всеобщей истории ИВУ В 1885–1886 гг. – приват-доцент при кафедре всеобщей истории ИСПбУ В 1886–1890 гг. – экстраординарный профессор по кафедре всеобщей истории ИСПбУ В 1890–1899 гг. – ординарный профессор по кафедре всеобщей истории ИСПбУ В 1906–1906 гг. – приват-доцент при кафедре всеобщей истории ИСПбУ В 1906–1918 гг. – сверхштатный ординарный профессор по кафедре всеобщей истории ИСПбУ